Hola David.
El esquema esta correcto, en el módulo 5 veremos el tema de las calificaciones, Moodle nos permite definir nuestras propias calificaciones. Si queremos que una actividad sea obligatoria pero no evaluable activaremos el rastreo de finalización de la misma (en el módulo correspondiente veremos como) y exigiremos que se haya marcado como finalizada para la finalización del curso. En este curso a partir del módulo 3 ya empezareis a ver actividades con el rastreo de finalización activo e incluso hemos incluido restricciones de acceso por lo que debereis de finalizar las actividades del módulo 4 para poder pasar al 5 y al 6.
En cuanto a la bibliografia, la cantidad de información que hay de Moodle es muy amplia lo cual facilita bastante el trabajo. Yo os ire dejando en Twitter enlaces tanto a información como a recursos o incluso algunos cursos en los que se puede entrar de invitado y resultan muy interesantes.
Un saludo, Manuel